MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Megasphaera elsdenii DSM 20460

Total Repeats: 7432

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015873	T	6	6	69	74	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015873	TTCGT	2	10	77	86	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015873	TA	3	6	109	114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015873	C	6	6	1278	1283	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_015873	CTT	2	6	1287	1292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015873	TGC	2	6	1294	1299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015873	TC	3	6	1310	1315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015873	TTCC	2	8	10299	10306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015873	GGC	2	6	10374	10379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015873	TAA	2	6	10383	10388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015873	TGAA	2	8	13939	13946	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015873	ATG	2	6	14002	14007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015873	CAT	2	6	14055	14060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015873	CCT	2	6	17514	17519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015873	TTC	2	6	17583	17588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015873	ACG	2	6	18426	18431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015873	GTT	2	6	18446	18451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015873	AGTT	2	8	18462	18469	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015873	ATG	2	6	18554	18559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015873	TAC	2	6	18609	18614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015873	CTCC	2	8	19135	19142	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_015873	TCTAT	2	10	19155	19164	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015873	AT	3	6	19171	19176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015873	AGAA	2	8	19181	19188	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015873	AAG	2	6	19190	19195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015873	A	8	8	19222	19229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015873	GAGG	2	8	19268	19275	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015873	AAG	2	6	19387	19392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015873	T	7	7	19425	19431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015873	T	6	6	19436	19441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015873	A	7	7	20873	20879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015873	ATC	3	9	20885	20893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015873	A	7	7	20923	20929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015873	GA	3	6	20964	20969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015873	CA	3	6	21027	21032	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015873	AGGCC	2	10	21078	21087	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_015873	GT	3	6	21095	21100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015873	ATG	2	6	21119	21124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015873	TTA	2	6	21131	21136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015873	CTT	2	6	21145	21150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015873	TCA	2	6	24952	24957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015873	TTA	2	6	27235	27240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015873	AT	3	6	27265	27270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015873	A	6	6	29386	29391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015873	TAA	2	6	29408	29413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015873	TGT	2	6	29432	29437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015873	GAT	2	6	29659	29664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015873	A	7	7	29665	29671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015873	T	7	7	29694	29700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015873	CGG	2	6	29750	29755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015873	ACCT	2	8	36695	36702	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015873	A	7	7	36721	36727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015873	TCG	2	6	36731	36736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015873	GCC	2	6	36763	36768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_015873	TA	3	6	38260	38265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015873	TTA	2	6	38286	38291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015873	AT	3	6	38299	38304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015873	ATA	2	6	38348	38353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015873	GTA	2	6	38361	38366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015873	GGC	2	6	38376	38381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015873	CTTTT	2	10	38393	38402	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015873	CCT	2	6	40865	40870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015873	GCT	2	6	40871	40876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015873	TATT	2	8	40927	40934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015873	CCTGC	2	10	41066	41075	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
66	NC_015873	TA	3	6	41077	41082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015873	ATA	2	6	41085	41090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015873	ATA	2	6	41105	41110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015873	GTC	2	6	41155	41160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015873	AGG	2	6	41165	41170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015873	GGCC	2	8	43294	43301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015873	ACTC	2	8	44767	44774	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015873	CTC	2	6	45595	45600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_015873	ATT	2	6	45601	45606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015873	GAAT	2	8	45618	45625	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015873	CTTT	2	8	45628	45635	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015873	A	6	6	45663	45668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015873	A	6	6	45688	45693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015873	TAA	2	6	45792	45797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015873	AAC	2	6	45850	45855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015873	T	6	6	45874	45879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015873	CCT	2	6	46093	46098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_015873	TAT	2	6	46118	46123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015873	CTTG	2	8	46124	46131	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015873	CTTT	2	8	47397	47404	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015873	ACA	2	6	47453	47458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015873	A	6	6	47491	47496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015873	CAT	2	6	47571	47576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015873	GAC	2	6	50668	50673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015873	GTT	2	6	50686	50691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015873	AGTT	2	8	50702	50709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015873	CTGA	2	8	50777	50784	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015873	CGG	2	6	50863	50868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015873	GCC	2	6	50869	50874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_015873	TCAA	2	8	51446	51453	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015873	ATGA	2	8	51535	51542	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015873	ATTTT	2	10	51548	51557	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015873	TGCC	2	8	51562	51569	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015873	GTA	2	6	51603	51608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015873	AGG	2	6	51649	51654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015873	GGT	2	6	52905	52910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015873	A	7	7	54026	54032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015873	A	6	6	54059	54064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015873	T	8	8	54087	54094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015873	ATT	2	6	54133	54138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015873	CAAA	2	8	54145	54152	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015873	A	6	6	55767	55772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015873	TTA	2	6	55782	55787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015873	GTTA	2	8	55849	55856	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015873	GAAA	2	8	55860	55867	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015873	CAA	2	6	55876	55881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015873	TTTAAA	2	12	55959	55970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015873	TCA	2	6	56248	56253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015873	TAA	2	6	56278	56283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015873	TAT	2	6	56308	56313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015873	AT	3	6	56319	56324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015873	ATT	2	6	56340	56345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015873	ATA	2	6	57856	57861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015873	TCC	2	6	57868	57873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_015873	A	6	6	57940	57945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015873	CA	3	6	57974	57979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015873	GGAT	2	8	57983	57990	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015873	TATT	2	8	58035	58042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015873	GAC	2	6	60022	60027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015873	A	7	7	60033	60039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015873	GCC	2	6	60042	60047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_015873	TAT	2	6	60130	60135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015873	ATC	2	6	60150	60155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015873	CGC	2	6	60183	60188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_015873	A	7	7	60343	60349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015873	AG	3	6	60399	60404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015873	TGG	2	6	60451	60456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015873	AGG	2	6	60474	60479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015873	AATTT	2	10	61695	61704	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015873	CAC	2	6	61734	61739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_015873	T	7	7	61761	61767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015873	AAC	2	6	61785	61790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015873	CGC	2	6	61826	61831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_015873	AAC	2	6	61846	61851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015873	GAA	2	6	61924	61929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015873	GCC	2	6	61954	61959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_015873	TCT	2	6	64938	64943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015873	T	7	7	68159	68165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015873	GGC	2	6	68246	68251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_015873	A	9	9	68258	68266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015873	TGG	2	6	68309	68314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015873	AGG	2	6	68320	68325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015873	TA	4	8	68388	68395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_015873	A	8	8	123219	123226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_015873	GCG	2	6	124171	124176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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293	NC_015873	TCG	2	6	124237	124242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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295	NC_015873	GAA	2	6	124297	124302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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427	NC_015873	AT	4	8	174115	174122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_015873	T	8	8	174211	174218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_015873	ATT	2	6	174257	174262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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